水是水溶性氯醋樹脂的關鍵構成成份，而水也是微生物菌種成長的良好氛圍，因此在水溶性氯醋樹脂的生產制造、存儲和應用中，總有可能由于微生物菌種的作用，造成水溶性氯醋樹脂構造的破環、商品霉變、發出臭味、長酶、掉色等問題。那麼有什么緣故會造成微生物菌種的滲入，又有什么方式可以控制水性樹脂造成異變呢？
水是關鍵緣故，盡管自來水歷經氯化處理，可是不可以避免微生物菌種的污染，另外因為實際操作上的欠缺，都會滲入某些病菌。如果滲入，這種病菌在水溶性氯醋樹脂中持續繁育生長發育，進而使商品霉變。因為水溶性氯醋樹脂在一些運用中必須加上水溶性色漿或黑色素，而這種水溶性色漿在生產制造生產過程也可能使微生物菌種滲入在其中，在適合的溫度標準下，總有可能為微生物菌種造就出適合的生產制造標準，致其大量繁育。